南京机场是由哪家航空公司拥有？

不属于任何一家航空公司，而是属于东部机场集团有限公司。

东部机场集团有限公司是省委、省政府从推动江苏高质量发展走在全国前列，加快建设“强富美高”新江苏，推动全省机场资源整合的战略高度出发，依托于南京禄口国际机场组建的全省机场集团。集团注册资本由原来的75亿元增资到120亿元，按照省市共建的原则，采用现金收购方式，受让徐州、常州、淮安、盐城、扬泰等5家机场公司51%的股权，以及连云港机场60%的股权，6家机场公司成为机场集团的控股子公司。